KRAV tillåter naturläkemedel och homeopati. Reglerna säger att läkemedel som används ska ha en påvisbar effekt och vara lämpligast i varje enskilt sjukdomsfall. Sjukdomsnivån inom djurhållningen ska hållas låg genom goda djurmiljöer, skötsel och utfodringsrutiner. Djur som trots detta har insjuknat, eller visar tecken på sjukdom, ska enligt KRAVs regler omgående behandlas. Om det inte sker kan hela besättningen underkännas. Vid användning av veterinärmedicinska preparat är karenstiden längre, se KRAVs regler 5.11.7 (utgåva januari 2010).